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菌群多樣性組成譜測(cè)序

菌群多樣性組成譜測(cè)序以細(xì)菌 / 古菌 16S rRNA 基因可變區(qū)、真菌 18S rRNA 基因可變區(qū)或真菌 ITS（Internaltranscribed spacer）內(nèi)轉(zhuǎn)錄間隔區(qū)等微生物特征序列（Signature sequence）為靶點(diǎn)......

標(biāo)記基因全長(zhǎng)測(cè)序

以PacBio公司的RS II和最新的Sequel測(cè)序系統(tǒng)為代表的第三代測(cè)序技術(shù)，通過(guò)SMRT單分子實(shí)時(shí)測(cè)序技術(shù)（Single molecule real-time sequencing），可以對(duì)DNA序列實(shí)現(xiàn)單分子級(jí)別的超長(zhǎng)讀長(zhǎng)測(cè)序，因而能夠輕易讀取微生物的rRNA基因/ITS全長(zhǎng)序列，不再受制于短序列的局限性，更全面的揭示物種多樣性

擴(kuò)增子/功能基因測(cè)序

借助合適的類群特異性引物，可以檢測(cè)菌群中特定種類 / 功能微生物的特征序列，反映菌群中該特定類群微生物的組成結(jié)構(gòu)，從而發(fā)現(xiàn)它們的分布特征，闡明樣本間多樣性和組成差異，進(jìn)而揭示該類群微生物中與差異相關(guān)聯(lián)的關(guān)鍵成員。

宏轉(zhuǎn)錄組測(cè)序

宏轉(zhuǎn)錄組學(xué)（Metatranscriptomics）的研究對(duì)象是微生物組mRNA，在獲取微生物組總RNA并去除rRNA之后，反轉(zhuǎn)錄為cDNA，并構(gòu)建合適長(zhǎng)度的插入片段文庫(kù)，對(duì)這些文庫(kù)進(jìn)行雙端（Paired-end，PE）高通量測(cè)序，從而能精確定量整個(gè)菌群中具有活性的物種精細(xì)組成及其對(duì)應(yīng)功能的表達(dá)水平，進(jìn)而鎖定菌群中的關(guān)鍵生物標(biāo)記物、闡明其生物學(xué)意義。

宏基因組測(cè)序

宏基因組學(xué) (Metagenomics) 研究通過(guò)全基因組鳥槍法 (Whole Genome Shotgun， WGS) 測(cè)序策略，將提取獲得的微生物組總 DNA 隨機(jī)打斷為短片段，并構(gòu)建合適長(zhǎng)度的插入片段文庫(kù)，對(duì)這些文庫(kù)進(jìn)行雙端 (Paired-end， PE) 高通量測(cè)序，從而能全面精細(xì)地展示整個(gè)菌群的功能代謝譜和物種精細(xì)組成譜，進(jìn)而在組成和功能水平分別挖掘關(guān)鍵生物標(biāo)記物，從原理上闡明微生物群落在生態(tài)系統(tǒng)中發(fā)揮作用的根本機(jī)制。